科研人员利用一个纯合的野生型红眼果蝇种群做实验，偶然得到一只棕眼果蝇，于是将该棕眼果蝇与一只野生型红眼果蝇杂交，F₁雌雄果蝇均为红眼，F₁雌雄个体相互交配，F₂表现型及比例为红眼：棕眼=3：1。欲研究红眼基因与棕眼基因的显隐性关系，并推断这对基因是位于常染色体上、仅位于X染色体上还是位于X、Y同源区(图中黑色部分)，进行了以下分析及实验活动，请回答：