青藏高原可可西里地区属于高原山地气候,夏凉冬寒,降水少,冬季多大风。该地湖泊众多,由于气候的变化,2000年以后卓乃湖扩展迅速。2011年9月卓乃湖东侧发生溃堤,大量湖水外泄,库赛湖、海丁诺尔湖也相继蓄满,多余水量全部进入盐湖。此后四湖连通;卓乃湖面积迅速减少,周边风沙严重;盐湖面积增加。下图为卓乃湖流域1961年至2018年的气候统计图。图8为卓乃湖流域示意图。