菠菜为雌雄异株的植物（性别决定方式为XY型），菠菜叶片圆叶与尖叶由等位基因（A、a）控制，不耐寒与耐寒由等位基因（H、h）控制，种子圆形和卵圆形由等位基因（R、r）控制。