怀化一直坚持“生态优先，绿色发展”，市域内森林、沼泽、湖泊、河流交错分布。境内拥有沅陵借母溪、通道玉带河等众多自然保护区。保护区内拥有大量的珍稀动植物，其中国家级保护动物有白鹳、中华小鲵、大鲵等；国家级保护植物有珙桐、银杏等。