甘肃祁连山国家级自然保护区成立于1988年（如图中的阴影区）。近些年来，因为违法违规开发矿产资源；部分水电设施违法建设、违规运行；企业偷排偷放；生态环境突出问题整改不力，导致保护区环境问题日趋严重。2017年7月21日，中共中央办公厅、国务院办公厅就甘肃祁连山国家级自然保护区生态环境问题发出通报，并严肃处理了一批相关责任人。