百花山国家级自然保护区动植物资源丰富。植物种类有 130 科，1100 种，如金莲花、胭脂花、有斑百合、丁香、芍药等。动物种类有 47 科 169 种，其中国家一级保护动物有金钱豹、褐马鸡、金雕，国家二级保护动物有斑羚、勺鸡。