郑州黄河湿地自然保护区内物种丰富,生态系统类型多样,是我国中部地区生物多样性分布最为丰富的地区之一、保护区还位于我国候鸟迁徙三大通道的中线通道,也是鸟类重要的繁殖地和越冬地。
据调查,黄河湿地自然保护区内共有维管束植物598种、鸟类169种、两栖类10种、爬行类17种。其中野大豆是国家二级重点保护野生植物,黑鹳、白尾海雕、白肩雕等10种鸟类是国家一级重点保护动物。