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在食品和医药领域实践中，对于大肠杆菌的计数有多种方法。用细菌计数板在显微镜下直接计数，可测算出样品的细菌密度，但操作复杂、对设备要求高，且耗时较长。但ATP生物发光法是一种经过简化的生物化学方法。在有氧气和ATP的条件下，荧光素酶能催化荧光素的氧化而发出荧光，如下图所示。

荧光强度可用荧光强度测定仪进行测量。因为每种微生物细胞中的ATP含量是恒定的，所以可用于微生物数量的测定。该方法能测定食品中是否存在酵母菌、霉菌或细菌细胞，灵敏度可达1个微生物/200mL 。ATP生物发光法的实施先要构建荧光强度—大肠杆菌密度函数模型。利用该函数模型和被检测样品组的荧光强度快速计算出被检测样本的菌种密度。