入冬后,冬虫夏草菌成熟的子囊孢子,也随雨水渗入土里,一旦发现蝙蝠蛾的幼虫,便黏附在幼虫柔软的体表,钻进幼虫的体腔,以幼虫的内脏为养料,滋生出无数菌丝。可怜的虫子,任凭虫草菌以出芽的方式,在自己体内增殖却无能为力。这种致命的侵染要维持2到3周。随着蝙蝠蛾幼虫生命体征消失,它的五脏六会被坚硬的虫草菌丝体塞满。柔软蠕动的蝙蝠蛾幼虫,从此成为坚硬的慢虫形菌核。冬虫夏草菌没有了食物后就进入休眠期。来年春末夏初,虫子的头部会长出一根圆棒状的子实体,高约2至5厘米,即所谓的“夏草”,真菌学家称之为“子囊果”,一颗“子囊果”长着数以亿万计的子囊孢子。大部分孢子离开母体后不久结束自己的生命,只有很少部分随雨水渗入土壤,找到蝙蝠蛾的幼虫,从此过上“穴居”生活,如此循环往复。